Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT20P35900 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT20P35900 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT20P35900 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT20P35900 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT20P35900 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT20P35900 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT20P35900 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT20P35900 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT20P35900 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT20P35900 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT20P35900 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT20P35900 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT20P35900 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT20P35900 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT20P35900 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT20P35900 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT20P35900 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT20P35900 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT20P35900 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT20P35900 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT20P35900 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT20P35900 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT20P35900 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT20P35900 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT20P35900 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT20P35900 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT20P35900 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT20P35900 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT20P35900 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT20P35900 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT20P35900 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT20P35900 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT20P35900 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT20P35900 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT20P35900 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT20P35900 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT20P35900 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT20P35900 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT20P35900 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT20P35900 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT20P35900 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT20P35900 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT20P35900 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT20P35900 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT20P35900 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT20P35900 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT20P35900 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT20P35900 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT20P35900 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT20P35900 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT20P35900 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT20P35900 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT20P35900 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT20P35900 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT20P35900 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT20P35900 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT20P35900 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT20P35900 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT20P35900 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT20P35900 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT20P35900 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT20P35900 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT20P35900 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT20P35900 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT20P35900 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT20P35900 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT20P35900 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT20P35900 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT20P35900 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT20P35900 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT20P35900 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT20P35900 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT20P35900 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT20P35900 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT20P35900 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT20P35900 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT20P35900 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT20P35900 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT20P35900 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT20P35900 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT20P35900 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT20P35900 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT20P35900 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT20P35900 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT20P35900 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT20P35900 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT20P35900 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT20P35900 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT20P35900 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT20P35900 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT20P35900 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT20P35900 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT20P35900 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT20P35900 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT20P35900 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT20P35900 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT20P35900 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT20P35900 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT20P35900 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms