Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYH11P35749 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYH11P35749 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYH11P35749 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYH11P35749 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYH11P35749 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYH11P35749 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYH11P35749 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYH11P35749 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYH11P35749 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYH11P35749 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYH11P35749 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYH11P35749 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYH11P35749 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYH11P35749 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYH11P35749 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYH11P35749 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYH11P35749 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYH11P35749 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYH11P35749 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYH11P35749 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYH11P35749 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYH11P35749 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYH11P35749 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MYH11P35749 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYH11P35749 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYH11P35749 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYH11P35749 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYH11P35749 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYH11P35749 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYH11P35749 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYH11P35749 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYH11P35749 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYH11P35749 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYH11P35749 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYH11P35749 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYH11P35749 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYH11P35749 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYH11P35749 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYH11P35749 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYH11P35749 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYH11P35749 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYH11P35749 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYH11P35749 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYH11P35749 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYH11P35749 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYH11P35749 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MYH11P35749 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYH11P35749 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYH11P35749 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYH11P35749 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYH11P35749 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYH11P35749 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYH11P35749 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYH11P35749 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYH11P35749 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYH11P35749 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYH11P35749 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MYH11P35749 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYH11P35749 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYH11P35749 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYH11P35749 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYH11P35749 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MYH11P35749 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYH11P35749 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYH11P35749 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYH11P35749 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYH11P35749 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYH11P35749 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYH11P35749 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYH11P35749 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MYH11P35749 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYH11P35749 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYH11P35749 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYH11P35749 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYH11P35749 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYH11P35749 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYH11P35749 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYH11P35749 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYH11P35749 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYH11P35749 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYH11P35749 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYH11P35749 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYH11P35749 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MYH11P35749 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYH11P35749 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MYH11P35749 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYH11P35749 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYH11P35749 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MYH11P35749 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYH11P35749 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYH11P35749 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYH11P35749 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYH11P35749 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MYH11P35749 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYH11P35749 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYH11P35749 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYH11P35749 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYH11P35749 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYH11P35749 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms