Protein–RNA interactions for Protein: P32927

CSF2RB, Cytokine receptor common subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RBP32927 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF2RBP32927 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF2RBP32927 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF2RBP32927 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2RBP32927 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2RBP32927 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF2RBP32927 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSF2RBP32927 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF2RBP32927 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms