Protein–RNA interactions for Protein: P31483

TIA1, Nucleolysin TIA-1 isoform p40, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIA1P31483 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.037e-11■■■■■ 32
TIA1P31483 NUDT21-201ENST00000300291 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.918e-9■■■■■ 32
TIA1P31483 BTG1-201ENST00000256015 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.434e-9■■■■■ 32
TIA1P31483 AP000561.1-201ENST00000444130 435 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.951e-7■■■■■ 31.9
TIA1P31483 SPP1-203ENST00000395080 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.686e-8■■■■■ 31.9
TIA1P31483 SPP1-211ENST00000614857 1558 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.866e-8■■■■■ 31.9
TIA1P31483 SPP1-201ENST00000237623 1581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.066e-8■■■■■ 31.9
TIA1P31483 SPP1-209ENST00000509659 1664 ntTSL 1 (best)7□□□□□ -1.296e-8■■■■■ 31.9
TIA1P31483 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.22■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 31.9
TIA1P31483 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.38e-9■■■■■ 31.9
TIA1P31483 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.028e-9■■■■■ 31.9
TIA1P31483 VPS26A-203ENST00000395098 2554 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.48e-9■■■■■ 31.9
TIA1P31483 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 31.8
TIA1P31483 ZC3H4-202ENST00000594019 3259 ntTSL 210.78□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 31.8
TIA1P31483 SMARCA1-201ENST00000371121 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.654e-7■■■■■ 31.8
TIA1P31483 SMARCA1-205ENST00000617310 4291 ntTSL 29.74□□□□□ -0.854e-7■■■■■ 31.8
TIA1P31483 SMARCA1-202ENST00000371122 4099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.014e-7■■■■■ 31.8
TIA1P31483 SMARCA1-203ENST00000371123 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.124e-7■■■■■ 31.8
TIA1P31483 EIF1-202ENST00000462917 2170 ntTSL 1 (best)17.82■□□□□ 0.445e-42■■■■■ 31.8
TIA1P31483 EIF1-201ENST00000310837 1120 ntTSL 1 (best)8.15□□□□□ -1.15e-42■■■■■ 31.8
TIA1P31483 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.445e-42■■■■■ 31.8
TIA1P31483 EIF1-205ENST00000482111 1428 ntTSL 25.72□□□□□ -1.495e-42■■■■■ 31.8
TIA1P31483 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.556e-8■■■■■ 31.8
TIA1P31483 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.46e-8■■■■■ 31.8
TIA1P31483 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.274e-9■■■■■ 31.7
TIA1P31483 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.374e-9■■■■■ 31.7
TIA1P31483 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.484e-9■■■■■ 31.7
TIA1P31483 USP16-205ENST00000474835 3835 ntTSL 1 (best)3.76□□□□□ -1.814e-9■■■■■ 31.7
TIA1P31483 MGST3-211ENST00000494074 772 ntTSL 27.08□□□□□ -1.283e-7■■■■■ 31.7
TIA1P31483 RBM39-222ENST00000461849 861 ntTSL 212.87□□□□□ -0.352e-8■■■■■ 31.7
TIA1P31483 RBM39-238ENST00000493853 567 ntTSL 46.84□□□□□ -1.312e-8■■■■■ 31.7
TIA1P31483 MTHFD2-201ENST00000394053 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.767e-11■■■■■ 31.7
TIA1P31483 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 31.6
TIA1P31483 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 31.6
TIA1P31483 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 31.6
TIA1P31483 SRSF11-213ENST00000481648 389 ntTSL 39.95□□□□□ -0.823e-10■■■■■ 31.6
TIA1P31483 ITCH-205ENST00000483727 1070 ntTSL 52.96□□□□□ -1.942e-7■■■■■ 31.6
TIA1P31483 ITCH-203ENST00000461661 450 ntTSL 52.09□□□□□ -2.072e-7■■■■■ 31.6
TIA1P31483 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.29□□□□□ -1.723e-25■■■■■ 31.6
TIA1P31483 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.423e-9■■■■■ 31.6
TIA1P31483 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.133e-9■■■■■ 31.6
TIA1P31483 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.913e-9■■■■■ 31.6
TIA1P31483 PIGG-221ENST00000511666 658 ntTSL 315.36■□□□□ 0.051e-17■■■■■ 31.6
TIA1P31483 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.171e-17■■■■■ 31.6
TIA1P31483 PIGG-206ENST00000503261 626 ntTSL 513.93□□□□□ -0.181e-17■■■■■ 31.6
TIA1P31483 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.371e-17■■■■■ 31.6
TIA1P31483 PIGG-201ENST00000310340 3203 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.481e-17■■■■■ 31.6
TIA1P31483 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.511e-17■■■■■ 31.6
TIA1P31483 PIGG-223ENST00000513239 3519 ntTSL 1 (best)9.82□□□□□ -0.841e-17■■■■■ 31.6
TIA1P31483 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.93e-9■■■■■ 31.5
TIA1P31483 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.693e-9■■■■■ 31.5
TIA1P31483 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.643e-9■■■■■ 31.5
TIA1P31483 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.193e-9■■■■■ 31.5
TIA1P31483 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.153e-9■■■■■ 31.5
TIA1P31483 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.153e-9■■■■■ 31.5
TIA1P31483 UBE2C-205ENST00000372568 914 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.043e-9■■■■■ 31.5
TIA1P31483 FUBP1-201ENST00000294623 2201 ntTSL 1 (best)13.44□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 31.5
TIA1P31483 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 31.5
TIA1P31483 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 31.5
TIA1P31483 SMARCC1-202ENST00000425518 3827 ntTSL 27.21□□□□□ -1.251e-11■■■■■ 31.5
TIA1P31483 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.182e-9■■■■■ 31.5
TIA1P31483 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.932e-9■■■■■ 31.5
TIA1P31483 SH2D3A-204ENST00000595681 1750 ntTSL 519.4■□□□□ 0.72e-9■■■■■ 31.5
TIA1P31483 SH2D3A-205ENST00000597168 512 ntTSL 510.9□□□□□ -0.662e-9■■■■■ 31.5
TIA1P31483 HNRNPA2B1-206ENST00000490912 5328 ntTSL 214.38□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 31.5
TIA1P31483 HNRNPA2B1-202ENST00000356674 1711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 31.5
TIA1P31483 PRKAR1A-211ENST00000586397 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.057e-7■■■■■ 31.5
TIA1P31483 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.481e-8■■■■■ 31.4
TIA1P31483 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.771e-8■■■■■ 31.4
TIA1P31483 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.111e-9■■■■■ 31.4
TIA1P31483 CENPO-209ENST00000498362 761 ntTSL 513.91□□□□□ -0.181e-9■■■■■ 31.4
TIA1P31483 CENPO-207ENST00000486527 748 ntTSL 213.91□□□□□ -0.181e-9■■■■■ 31.4
TIA1P31483 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.241e-9■■■■■ 31.4
TIA1P31483 CENPO-206ENST00000473706 4272 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.561e-9■■■■■ 31.4
TIA1P31483 CENPO-208ENST00000491031 1579 ntTSL 211.51□□□□□ -0.571e-9■■■■■ 31.4
TIA1P31483 CENPO-201ENST00000260662 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.731e-9■■■■■ 31.4
TIA1P31483 MRPL30-204ENST00000465432 1752 ntTSL 59.01□□□□□ -0.971e-9■■■■■ 31.4
TIA1P31483 MRPL30-201ENST00000338148 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.011e-9■■■■■ 31.4
TIA1P31483 MRPL30-203ENST00000409841 1497 ntTSL 54.7□□□□□ -1.661e-9■■■■■ 31.4
TIA1P31483 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.543e-21■■■■■ 31.4
TIA1P31483 CHD9-217ENST00000565832 2169 ntTSL 1 (best)5.93□□□□□ -1.466e-9■■■■■ 31.4
TIA1P31483 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.76e-9■■■■■ 31.4
TIA1P31483 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.926e-9■■■■■ 31.4
TIA1P31483 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.986e-9■■■■■ 31.4
TIA1P31483 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.996e-9■■■■■ 31.4
TIA1P31483 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -26e-9■■■■■ 31.4
TIA1P31483 CHD9-209ENST00000564255 2896 ntTSL 52.51□□□□□ -2.016e-9■■■■■ 31.4
TIA1P31483 HNRNPH1-239ENST00000521173 831 ntTSL 510.12□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 31.3
TIA1P31483 PTEN-205ENST00000498703 554 ntTSL 22.62□□□□□ -1.994e-9■■■■■ 31.3
TIA1P31483 MTHFD2-202ENST00000409601 1865 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.521e-10■■■■■ 31.3
TIA1P31483 MTHFD2-203ENST00000409804 1757 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.061e-10■■■■■ 31.3
TIA1P31483 ADAM9-201ENST00000379917 3836 ntTSL 1 (best)9.52□□□□□ -0.885e-13■■■■■ 31.3
TIA1P31483 ADAM9-209ENST00000487273 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.915e-13■■■■■ 31.3
TIA1P31483 ADAM9-207ENST00000481873 3793 ntTSL 1 (best)9.07□□□□□ -0.965e-13■■■■■ 31.3
TIA1P31483 ADAM9-204ENST00000468065 3755 ntTSL 1 (best)8.69□□□□□ -1.025e-13■■■■■ 31.3
TIA1P31483 ZBTB48-204ENST00000466813 790 ntTSL 317.7■□□□□ 0.421e-8■■■■■ 31.3
TIA1P31483 ZBTB48-206ENST00000482360 2484 ntTSL 1 (best)16.28■□□□□ 0.21e-8■■■■■ 31.3
TIA1P31483 ZBTB48-208ENST00000498342 2461 ntTSL 214.57□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 31.3
TIA1P31483 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.125e-9■■■■■ 31.3
TIA1P31483 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.375e-11■■■■■ 31.2
Retrieved 100 of 17,249 protein–RNA pairs in 158.6 ms