Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMB5P28074 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMB5P28074 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB5P28074 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms