Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HMGB2P26583 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HMGB2P26583 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
HMGB2P26583 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
HMGB2P26583 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGB2P26583 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGB2P26583 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGB2P26583 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGB2P26583 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGB2P26583 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HMGB2P26583 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGB2P26583 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGB2P26583 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGB2P26583 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HMGB2P26583 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HMGB2P26583 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HMGB2P26583 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
HMGB2P26583 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HMGB2P26583 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HMGB2P26583 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HMGB2P26583 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HMGB2P26583 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HMGB2P26583 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
HMGB2P26583 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
HMGB2P26583 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HMGB2P26583 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HMGB2P26583 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
HMGB2P26583 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
HMGB2P26583 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
HMGB2P26583 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
HMGB2P26583 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HMGB2P26583 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HMGB2P26583 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HMGB2P26583 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HMGB2P26583 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HMGB2P26583 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HMGB2P26583 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HMGB2P26583 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HMGB2P26583 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HMGB2P26583 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HMGB2P26583 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HMGB2P26583 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HMGB2P26583 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HMGB2P26583 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HMGB2P26583 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms