Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FGFR3P22607 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FGFR3P22607 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGFR3P22607 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGFR3P22607 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms