Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RASA1P20936 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RASA1P20936 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RASA1P20936 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RASA1P20936 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RASA1P20936 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RASA1P20936 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RASA1P20936 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RASA1P20936 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RASA1P20936 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RASA1P20936 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RASA1P20936 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RASA1P20936 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RASA1P20936 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RASA1P20936 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RASA1P20936 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RASA1P20936 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RASA1P20936 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RASA1P20936 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RASA1P20936 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RASA1P20936 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RASA1P20936 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RASA1P20936 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RASA1P20936 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RASA1P20936 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RASA1P20936 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RASA1P20936 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RASA1P20936 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RASA1P20936 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RASA1P20936 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RASA1P20936 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RASA1P20936 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RASA1P20936 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RASA1P20936 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RASA1P20936 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RASA1P20936 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RASA1P20936 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RASA1P20936 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RASA1P20936 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RASA1P20936 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RASA1P20936 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RASA1P20936 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RASA1P20936 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RASA1P20936 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RASA1P20936 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RASA1P20936 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RASA1P20936 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RASA1P20936 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RASA1P20936 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RASA1P20936 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RASA1P20936 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RASA1P20936 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RASA1P20936 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RASA1P20936 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RASA1P20936 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RASA1P20936 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RASA1P20936 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RASA1P20936 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RASA1P20936 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RASA1P20936 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RASA1P20936 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RASA1P20936 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RASA1P20936 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RASA1P20936 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RASA1P20936 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RASA1P20936 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RASA1P20936 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RASA1P20936 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RASA1P20936 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RASA1P20936 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RASA1P20936 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RASA1P20936 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RASA1P20936 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RASA1P20936 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RASA1P20936 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RASA1P20936 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RASA1P20936 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RASA1P20936 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RASA1P20936 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RASA1P20936 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RASA1P20936 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RASA1P20936 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RASA1P20936 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RASA1P20936 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RASA1P20936 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RASA1P20936 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RASA1P20936 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RASA1P20936 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RASA1P20936 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RASA1P20936 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RASA1P20936 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RASA1P20936 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RASA1P20936 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RASA1P20936 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RASA1P20936 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RASA1P20936 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RASA1P20936 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RASA1P20936 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASA1P20936 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASA1P20936 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms