Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTPS1P17812 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTPS1P17812 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTPS1P17812 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTPS1P17812 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTPS1P17812 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTPS1P17812 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTPS1P17812 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTPS1P17812 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTPS1P17812 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTPS1P17812 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTPS1P17812 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms