Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TOP1P11387 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOP1P11387 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOP1P11387 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOP1P11387 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOP1P11387 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOP1P11387 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOP1P11387 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TOP1P11387 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TOP1P11387 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TOP1P11387 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TOP1P11387 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOP1P11387 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOP1P11387 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOP1P11387 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOP1P11387 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TOP1P11387 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP1P11387 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP1P11387 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP1P11387 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP1P11387 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP1P11387 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP1P11387 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP1P11387 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP1P11387 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP1P11387 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP1P11387 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP1P11387 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP1P11387 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP1P11387 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP1P11387 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP1P11387 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP1P11387 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP1P11387 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP1P11387 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP1P11387 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOP1P11387 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOP1P11387 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP1P11387 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP1P11387 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP1P11387 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP1P11387 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP1P11387 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOP1P11387 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOP1P11387 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TOP1P11387 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TOP1P11387 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOP1P11387 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOP1P11387 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TOP1P11387 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TOP1P11387 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOP1P11387 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOP1P11387 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TOP1P11387 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOP1P11387 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOP1P11387 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOP1P11387 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOP1P11387 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOP1P11387 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOP1P11387 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOP1P11387 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOP1P11387 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOP1P11387 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOP1P11387 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOP1P11387 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOP1P11387 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOP1P11387 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TOP1P11387 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TOP1P11387 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOP1P11387 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOP1P11387 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOP1P11387 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOP1P11387 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TOP1P11387 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOP1P11387 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOP1P11387 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOP1P11387 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOP1P11387 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOP1P11387 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOP1P11387 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOP1P11387 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOP1P11387 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOP1P11387 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOP1P11387 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TOP1P11387 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOP1P11387 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOP1P11387 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOP1P11387 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOP1P11387 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOP1P11387 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOP1P11387 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOP1P11387 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP1P11387 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP1P11387 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP1P11387 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOP1P11387 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP1P11387 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP1P11387 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP1P11387 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOP1P11387 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms