Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX4

SMIM18, Small integral membrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM18P0DKX4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM18P0DKX4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM18P0DKX4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM18P0DKX4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms