Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLK3P07288 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLK3P07288 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLK3P07288 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLK3P07288 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLK3P07288 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLK3P07288 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLK3P07288 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLK3P07288 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLK3P07288 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLK3P07288 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLK3P07288 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLK3P07288 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLK3P07288 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLK3P07288 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLK3P07288 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLK3P07288 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLK3P07288 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLK3P07288 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLK3P07288 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLK3P07288 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLK3P07288 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLK3P07288 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLK3P07288 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLK3P07288 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLK3P07288 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLK3P07288 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLK3P07288 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLK3P07288 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLK3P07288 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLK3P07288 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLK3P07288 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLK3P07288 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLK3P07288 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLK3P07288 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLK3P07288 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLK3P07288 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLK3P07288 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLK3P07288 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLK3P07288 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLK3P07288 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLK3P07288 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLK3P07288 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLK3P07288 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLK3P07288 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLK3P07288 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLK3P07288 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLK3P07288 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLK3P07288 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLK3P07288 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLK3P07288 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLK3P07288 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLK3P07288 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLK3P07288 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLK3P07288 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLK3P07288 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLK3P07288 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLK3P07288 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLK3P07288 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLK3P07288 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLK3P07288 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLK3P07288 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLK3P07288 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLK3P07288 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLK3P07288 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLK3P07288 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLK3P07288 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLK3P07288 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLK3P07288 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLK3P07288 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLK3P07288 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLK3P07288 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLK3P07288 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLK3P07288 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLK3P07288 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLK3P07288 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLK3P07288 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLK3P07288 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLK3P07288 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLK3P07288 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLK3P07288 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLK3P07288 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLK3P07288 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLK3P07288 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLK3P07288 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KLK3P07288 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLK3P07288 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLK3P07288 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLK3P07288 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLK3P07288 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLK3P07288 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLK3P07288 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLK3P07288 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLK3P07288 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLK3P07288 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLK3P07288 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLK3P07288 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLK3P07288 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLK3P07288 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLK3P07288 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms