Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ITGB2P05107 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB2P05107 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB2P05107 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms