Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEMG1P04279 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMG1P04279 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms