Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SEMG1P04279 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SEMG1P04279 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SEMG1P04279 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SEMG1P04279 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SEMG1P04279 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SEMG1P04279 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SEMG1P04279 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SEMG1P04279 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SEMG1P04279 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SEMG1P04279 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SEMG1P04279 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SEMG1P04279 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SEMG1P04279 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SEMG1P04279 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SEMG1P04279 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SEMG1P04279 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SEMG1P04279 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SEMG1P04279 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SEMG1P04279 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEMG1P04279 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEMG1P04279 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SEMG1P04279 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEMG1P04279 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEMG1P04279 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEMG1P04279 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMG1P04279 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEMG1P04279 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEMG1P04279 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMG1P04279 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMG1P04279 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEMG1P04279 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEMG1P04279 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEMG1P04279 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEMG1P04279 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEMG1P04279 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEMG1P04279 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMG1P04279 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMG1P04279 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMG1P04279 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMG1P04279 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMG1P04279 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMG1P04279 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMG1P04279 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEMG1P04279 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEMG1P04279 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMG1P04279 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMG1P04279 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEMG1P04279 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEMG1P04279 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEMG1P04279 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEMG1P04279 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMG1P04279 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMG1P04279 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMG1P04279 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMG1P04279 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMG1P04279 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMG1P04279 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMG1P04279 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMG1P04279 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEMG1P04279 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SEMG1P04279 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMG1P04279 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMG1P04279 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEMG1P04279 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMG1P04279 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMG1P04279 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEMG1P04279 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEMG1P04279 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMG1P04279 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMG1P04279 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEMG1P04279 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMG1P04279 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMG1P04279 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMG1P04279 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMG1P04279 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMG1P04279 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMG1P04279 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEMG1P04279 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEMG1P04279 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMG1P04279 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMG1P04279 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMG1P04279 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMG1P04279 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMG1P04279 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMG1P04279 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMG1P04279 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMG1P04279 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMG1P04279 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SEMG1P04279 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SEMG1P04279 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMG1P04279 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMG1P04279 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMG1P04279 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMG1P04279 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMG1P04279 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMG1P04279 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMG1P04279 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMG1P04279 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMG1P04279 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms