Protein–RNA interactions for Protein: P01876

IGHA1, Immunoglobulin heavy constant alpha 1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHA1P01876 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHA1P01876 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
IGHA1P01876 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGHA1P01876 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IGHA1P01876 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHA1P01876 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHA1P01876 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHA1P01876 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHA1P01876 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
IGHA1P01876 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHA1P01876 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHA1P01876 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHA1P01876 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHA1P01876 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGHA1P01876 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHA1P01876 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGHA1P01876 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGHA1P01876 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IGHA1P01876 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHA1P01876 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IGHA1P01876 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHA1P01876 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHA1P01876 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHA1P01876 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHA1P01876 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHA1P01876 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IGHA1P01876 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHA1P01876 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHA1P01876 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGHA1P01876 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IGHA1P01876 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHA1P01876 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHA1P01876 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHA1P01876 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHA1P01876 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHA1P01876 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHA1P01876 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHA1P01876 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGHA1P01876 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGHA1P01876 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IGHA1P01876 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGHA1P01876 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGHA1P01876 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms