Protein–RNA interactions for Protein: O75596

CLEC3A, C-type lectin domain family 3 member A, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3AO75596 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC3AO75596 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLEC3AO75596 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC3AO75596 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC3AO75596 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC3AO75596 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLEC3AO75596 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLEC3AO75596 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLEC3AO75596 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLEC3AO75596 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLEC3AO75596 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLEC3AO75596 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC3AO75596 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms