Protein–RNA interactions for Protein: O75132

ZBED4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4O75132 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZBED4O75132 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED4O75132 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZBED4O75132 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED4O75132 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED4O75132 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZBED4O75132 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED4O75132 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED4O75132 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED4O75132 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZBED4O75132 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED4O75132 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED4O75132 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED4O75132 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED4O75132 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED4O75132 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZBED4O75132 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED4O75132 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED4O75132 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED4O75132 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED4O75132 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED4O75132 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ZBED4O75132 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ZBED4O75132 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZBED4O75132 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED4O75132 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms