Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NBNO60934 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBNO60934 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBNO60934 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBNO60934 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBNO60934 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBNO60934 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NBNO60934 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBNO60934 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NBNO60934 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NBNO60934 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBNO60934 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBNO60934 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBNO60934 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NBNO60934 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBNO60934 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBNO60934 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBNO60934 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NBNO60934 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBNO60934 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBNO60934 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBNO60934 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBNO60934 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBNO60934 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NBNO60934 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBNO60934 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBNO60934 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBNO60934 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBNO60934 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBNO60934 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBNO60934 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBNO60934 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NBNO60934 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBNO60934 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NBNO60934 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NBNO60934 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NBNO60934 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NBNO60934 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NBNO60934 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NBNO60934 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NBNO60934 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NBNO60934 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NBNO60934 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBNO60934 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBNO60934 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBNO60934 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NBNO60934 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBNO60934 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBNO60934 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NBNO60934 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBNO60934 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NBNO60934 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NBNO60934 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBNO60934 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBNO60934 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBNO60934 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBNO60934 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NBNO60934 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NBNO60934 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NBNO60934 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NBNO60934 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NBNO60934 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NBNO60934 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NBNO60934 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NBNO60934 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBNO60934 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBNO60934 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NBNO60934 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NBNO60934 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBNO60934 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBNO60934 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NBNO60934 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBNO60934 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBNO60934 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBNO60934 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBNO60934 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBNO60934 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBNO60934 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NBNO60934 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NBNO60934 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NBNO60934 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NBNO60934 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NBNO60934 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NBNO60934 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NBNO60934 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NBNO60934 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NBNO60934 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBNO60934 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBNO60934 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBNO60934 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBNO60934 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBNO60934 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBNO60934 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NBNO60934 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBNO60934 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBNO60934 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBNO60934 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBNO60934 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBNO60934 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NBNO60934 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms