Protein–RNA interactions for Protein: O43278

SPINT1, Kunitz-type protease inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT1O43278 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPINT1O43278 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPINT1O43278 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPINT1O43278 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPINT1O43278 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPINT1O43278 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPINT1O43278 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPINT1O43278 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPINT1O43278 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPINT1O43278 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPINT1O43278 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPINT1O43278 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPINT1O43278 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPINT1O43278 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPINT1O43278 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPINT1O43278 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPINT1O43278 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPINT1O43278 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPINT1O43278 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPINT1O43278 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms