Protein–RNA interactions for Protein: O15344

MID1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1O15344 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MID1O15344 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MID1O15344 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MID1O15344 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MID1O15344 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MID1O15344 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MID1O15344 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MID1O15344 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MID1O15344 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MID1O15344 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MID1O15344 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MID1O15344 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MID1O15344 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MID1O15344 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MID1O15344 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MID1O15344 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MID1O15344 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MID1O15344 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MID1O15344 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MID1O15344 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MID1O15344 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MID1O15344 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MID1O15344 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MID1O15344 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MID1O15344 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MID1O15344 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MID1O15344 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MID1O15344 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MID1O15344 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MID1O15344 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MID1O15344 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MID1O15344 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MID1O15344 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MID1O15344 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MID1O15344 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MID1O15344 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MID1O15344 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MID1O15344 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MID1O15344 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MID1O15344 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MID1O15344 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MID1O15344 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MID1O15344 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MID1O15344 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MID1O15344 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MID1O15344 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MID1O15344 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MID1O15344 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MID1O15344 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MID1O15344 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MID1O15344 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MID1O15344 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MID1O15344 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MID1O15344 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MID1O15344 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MID1O15344 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MID1O15344 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MID1O15344 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MID1O15344 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MID1O15344 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MID1O15344 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MID1O15344 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MID1O15344 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MID1O15344 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MID1O15344 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MID1O15344 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MID1O15344 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MID1O15344 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MID1O15344 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MID1O15344 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MID1O15344 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MID1O15344 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MID1O15344 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MID1O15344 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MID1O15344 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MID1O15344 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MID1O15344 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MID1O15344 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MID1O15344 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MID1O15344 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MID1O15344 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MID1O15344 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MID1O15344 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MID1O15344 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MID1O15344 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MID1O15344 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MID1O15344 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MID1O15344 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MID1O15344 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MID1O15344 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MID1O15344 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MID1O15344 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MID1O15344 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MID1O15344 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MID1O15344 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MID1O15344 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MID1O15344 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MID1O15344 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MID1O15344 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MID1O15344 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms