Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRDMT1O14717 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRDMT1O14717 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRDMT1O14717 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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