Protein–RNA interactions for Protein: O00567

NOP56, Nucleolar protein 56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56O00567 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP56O00567 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NOP56O00567 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NOP56O00567 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP56O00567 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP56O00567 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NOP56O00567 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP56O00567 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP56O00567 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP56O00567 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP56O00567 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP56O00567 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP56O00567 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP56O00567 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP56O00567 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NOP56O00567 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOP56O00567 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOP56O00567 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NOP56O00567 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NOP56O00567 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NOP56O00567 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOP56O00567 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOP56O00567 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOP56O00567 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOP56O00567 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NOP56O00567 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOP56O00567 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NOP56O00567 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NOP56O00567 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NOP56O00567 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NOP56O00567 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NOP56O00567 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP56O00567 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP56O00567 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP56O00567 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP56O00567 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP56O00567 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NOP56O00567 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOP56O00567 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOP56O00567 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOP56O00567 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOP56O00567 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOP56O00567 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOP56O00567 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOP56O00567 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOP56O00567 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NOP56O00567 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP56O00567 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP56O00567 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP56O00567 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP56O00567 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP56O00567 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP56O00567 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP56O00567 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP56O00567 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NOP56O00567 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOP56O00567 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOP56O00567 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOP56O00567 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOP56O00567 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NOP56O00567 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NOP56O00567 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NOP56O00567 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOP56O00567 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOP56O00567 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOP56O00567 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NOP56O00567 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NOP56O00567 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOP56O00567 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOP56O00567 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOP56O00567 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NOP56O00567 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP56O00567 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP56O00567 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP56O00567 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP56O00567 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOP56O00567 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOP56O00567 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NOP56O00567 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOP56O00567 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOP56O00567 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP56O00567 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP56O00567 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP56O00567 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP56O00567 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP56O00567 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOP56O00567 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOP56O00567 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOP56O00567 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NOP56O00567 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP56O00567 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP56O00567 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP56O00567 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP56O00567 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP56O00567 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP56O00567 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP56O00567 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP56O00567 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP56O00567 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP56O00567 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms