Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNAP23O00161 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SNAP23O00161 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SNAP23O00161 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SNAP23O00161 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SNAP23O00161 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SNAP23O00161 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNAP23O00161 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNAP23O00161 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNAP23O00161 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNAP23O00161 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SNAP23O00161 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SNAP23O00161 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SNAP23O00161 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNAP23O00161 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNAP23O00161 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNAP23O00161 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNAP23O00161 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SNAP23O00161 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SNAP23O00161 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SNAP23O00161 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms