Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
F8VP50 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
F8VP50 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
F8VP50 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
F8VP50 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
F8VP50 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
F8VP50 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
F8VP50 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
F8VP50 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
F8VP50 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
F8VP50 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
F8VP50 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
F8VP50 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
F8VP50 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
F8VP50 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
F8VP50 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
F8VP50 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
F8VP50 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
F8VP50 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
F8VP50 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
F8VP50 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
F8VP50 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
F8VP50 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
F8VP50 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
F8VP50 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
F8VP50 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
F8VP50 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
F8VP50 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
F8VP50 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
F8VP50 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
F8VP50 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
F8VP50 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
F8VP50 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
F8VP50 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
F8VP50 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
F8VP50 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
F8VP50 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
F8VP50 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
F8VP50 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
F8VP50 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
F8VP50 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
F8VP50 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
F8VP50 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
F8VP50 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
F8VP50 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
F8VP50 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
F8VP50 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
F8VP50 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
F8VP50 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
F8VP50 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
F8VP50 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
F8VP50 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
F8VP50 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
F8VP50 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
F8VP50 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
F8VP50 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
F8VP50 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
F8VP50 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
F8VP50 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
F8VP50 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
F8VP50 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
F8VP50 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
F8VP50 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
F8VP50 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
F8VP50 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
F8VP50 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
F8VP50 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
F8VP50 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
F8VP50 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
F8VP50 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
F8VP50 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
F8VP50 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
F8VP50 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
F8VP50 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
F8VP50 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
F8VP50 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
F8VP50 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
F8VP50 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
F8VP50 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
F8VP50 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
F8VP50 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
F8VP50 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
F8VP50 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
F8VP50 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
F8VP50 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
F8VP50 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
F8VP50 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
F8VP50 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
F8VP50 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
F8VP50 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
F8VP50 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
F8VP50 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
F8VP50 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
F8VP50 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
F8VP50 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
F8VP50 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
F8VP50 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
F8VP50 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
F8VP50 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
F8VP50 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms