Protein–RNA interactions for Protein: C9J4A7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9J4A7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9J4A7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9J4A7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9J4A7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9J4A7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9J4A7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9J4A7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9J4A7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9J4A7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9J4A7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9J4A7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9J4A7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9J4A7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9J4A7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9J4A7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9J4A7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9J4A7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9J4A7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9J4A7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9J4A7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9J4A7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9J4A7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9J4A7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9J4A7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9J4A7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9J4A7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9J4A7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9J4A7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9J4A7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9J4A7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9J4A7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9J4A7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C9J4A7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9J4A7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9J4A7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9J4A7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9J4A7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9J4A7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9J4A7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9J4A7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9J4A7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9J4A7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9J4A7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9J4A7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9J4A7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9J4A7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9J4A7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9J4A7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9J4A7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9J4A7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9J4A7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9J4A7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9J4A7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9J4A7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9J4A7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9J4A7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9J4A7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9J4A7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9J4A7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9J4A7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9J4A7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9J4A7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9J4A7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9J4A7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9J4A7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C9J4A7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C9J4A7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9J4A7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9J4A7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9J4A7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9J4A7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9J4A7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9J4A7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9J4A7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9J4A7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9J4A7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9J4A7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9J4A7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9J4A7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9J4A7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9J4A7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9J4A7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9J4A7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9J4A7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9J4A7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9J4A7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9J4A7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9J4A7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C9J4A7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9J4A7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9J4A7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9J4A7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9J4A7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9J4A7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9J4A7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9J4A7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9J4A7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9J4A7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9J4A7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9J4A7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216 ms