Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD8B2A6NJW9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CD8B2A6NJW9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD8B2A6NJW9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms