Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMBRA1Q9C0C7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms