Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC5Q00444 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms