Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PPARGP37231 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PPARGP37231 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARGP37231 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms