Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EBF4Q9BQW3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms