Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
LRP1Q07954 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms