Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYRO3Q06418 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms