Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TMEM258P61165 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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TMEM258P61165 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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TMEM258P61165 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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TMEM258P61165 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TMEM258P61165 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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