Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms