Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOA1P02647 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOA1P02647 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOA1P02647 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOA1P02647 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOA1P02647 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOA1P02647 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOA1P02647 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOA1P02647 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms