Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms