Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TWIST1Q15672 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms