Protein–RNA interactions for Protein: P01876

IGHA1, Immunoglobulin heavy constant alpha 1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHA1P01876 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHA1P01876 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms