Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
A4D1N5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
A4D1N5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
A4D1N5 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
A4D1N5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
A4D1N5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
A4D1N5 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
A4D1N5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
A4D1N5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
A4D1N5 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
A4D1N5 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
A4D1N5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
A4D1N5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms