RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489435.2

DNAJA4-210, Transcript of DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member A4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene DNAJA4, Length 947 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4-210ENST00000489435 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.05■■■■■ 5.6
DNAJA4-210ENST00000489435 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.66■■■■■ 4.74
DNAJA4-210ENST00000489435 ABCC9O60706 1549 aa44■■■■■ 4.63
DNAJA4-210ENST00000489435 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.2■■■■■ 4.35
DNAJA4-210ENST00000489435 NACADO15069 1562 aa42.06■■■■■ 4.32
DNAJA4-210ENST00000489435 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.01■■■■■ 4.32
DNAJA4-210ENST00000489435 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.68■■■■■ 4.26
DNAJA4-210ENST00000489435 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
DNAJA4-210ENST00000489435 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.39■■■■■ 4.22
DNAJA4-210ENST00000489435 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.2■■■■■ 4.19
DNAJA4-210ENST00000489435 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.06■■■■■ 4.16
DNAJA4-210ENST00000489435 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.87■■■■■ 4.13
DNAJA4-210ENST00000489435 SCRIBQ14160 1630 aa40.75■■■■■ 4.11
DNAJA4-210ENST00000489435 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.59■■■■■ 4.09
DNAJA4-210ENST00000489435 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.46■■■■■ 4.07
DNAJA4-210ENST00000489435 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.86■■■■□ 3.97
DNAJA4-210ENST00000489435 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.78■■■■□ 3.96
DNAJA4-210ENST00000489435 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.57■■■■□ 3.93
DNAJA4-210ENST00000489435 SMARCA4P51532 1647 aa38.92■■■■□ 3.82
DNAJA4-210ENST00000489435 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.84■■■■□ 3.81
DNAJA4-210ENST00000489435 NCAPD3P42695 1498 aa38.79■■■■□ 3.8
DNAJA4-210ENST00000489435 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.77■■■■□ 3.8
DNAJA4-210ENST00000489435 SMARCA2P51531 1590 aa38.74■■■■□ 3.79
DNAJA4-210ENST00000489435 HMGXB3Q12766 1538 aa38.59■■■■□ 3.77
DNAJA4-210ENST00000489435 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.57■■■■□ 3.76
DNAJA4-210ENST00000489435 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.51■■■■□ 3.76
DNAJA4-210ENST00000489435 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.47■■■■□ 3.75
DNAJA4-210ENST00000489435 WIZO95785 1651 aa38.15■■■■□ 3.7
DNAJA4-210ENST00000489435 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.68
DNAJA4-210ENST00000489435 ERCC6Q03468 1493 aa38.01■■■■□ 3.67
DNAJA4-210ENST00000489435 NESP48681 1621 aa37.97■■■■□ 3.67
DNAJA4-210ENST00000489435 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.85■■■■□ 3.65
DNAJA4-210ENST00000489435 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.74■■■■□ 3.63
DNAJA4-210ENST00000489435 CUX2O14529 1486 aa37.68■■■■□ 3.62
DNAJA4-210ENST00000489435 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.66■■■■□ 3.62
DNAJA4-210ENST00000489435 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.61■■■■□ 3.61
DNAJA4-210ENST00000489435 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.53■■■■□ 3.6
DNAJA4-210ENST00000489435 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
DNAJA4-210ENST00000489435 CFTRP13569 1480 aa37.36■■■■□ 3.57
DNAJA4-210ENST00000489435 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.27■■■■□ 3.56
DNAJA4-210ENST00000489435 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.25■■■■□ 3.55
DNAJA4-210ENST00000489435 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.25■■■■□ 3.55
DNAJA4-210ENST00000489435 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.25■■■■□ 3.55
DNAJA4-210ENST00000489435 WDR62O43379 1518 aa37.12■■■■□ 3.53
DNAJA4-210ENST00000489435 PRDM2Q13029 1718 aa37.08■■■■□ 3.53
DNAJA4-210ENST00000489435 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
DNAJA4-210ENST00000489435 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
DNAJA4-210ENST00000489435 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.85■■■■□ 3.49
DNAJA4-210ENST00000489435 ABCC8Q09428 1581 aa36.61■■■■□ 3.45
DNAJA4-210ENST00000489435 TOPBP1Q92547 1522 aa36.6■■■■□ 3.45
DNAJA4-210ENST00000489435 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.55■■■■□ 3.44
DNAJA4-210ENST00000489435 IFT140Q96RY7 1462 aa36.48■■■■□ 3.43
DNAJA4-210ENST00000489435 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
DNAJA4-210ENST00000489435 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
DNAJA4-210ENST00000489435 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
DNAJA4-210ENST00000489435 CUX1P39880 1505 aa36.2■■■■□ 3.39
DNAJA4-210ENST00000489435 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
DNAJA4-210ENST00000489435 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.15■■■■□ 3.38
DNAJA4-210ENST00000489435 SOGA1O94964 1423 aa36.13■■■■□ 3.37
DNAJA4-210ENST00000489435 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.12■■■■□ 3.37
DNAJA4-210ENST00000489435 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.06■■■■□ 3.36
DNAJA4-210ENST00000489435 OSCARQ8IYS5 282 aa36.06■■■■□ 3.36
DNAJA4-210ENST00000489435 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
DNAJA4-210ENST00000489435 WDR97A6NE52 1622 aa35.94■■■■□ 3.34
DNAJA4-210ENST00000489435 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.88■■■■□ 3.33
DNAJA4-210ENST00000489435 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.83■■■■□ 3.33
DNAJA4-210ENST00000489435 TOP2BQ02880 1626 aa35.82■■■■□ 3.32
DNAJA4-210ENST00000489435 SYNJ1O43426 1573 aa35.79■■■■□ 3.32
DNAJA4-210ENST00000489435 CHD1O14646 1710 aa35.78■■■■□ 3.32
DNAJA4-210ENST00000489435 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.78■■■■□ 3.32
DNAJA4-210ENST00000489435 GRIN2BQ13224 1484 aa35.75■■■■□ 3.31
DNAJA4-210ENST00000489435 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.75■■■■□ 3.31
DNAJA4-210ENST00000489435 FBLN2P98095 1184 aa35.75■■■■□ 3.31
DNAJA4-210ENST00000489435 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.72■■■■□ 3.31
DNAJA4-210ENST00000489435 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
DNAJA4-210ENST00000489435 PBRM1Q86U86 1689 aa35.67■■■■□ 3.3
DNAJA4-210ENST00000489435 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.66■■■■□ 3.3
DNAJA4-210ENST00000489435 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
DNAJA4-210ENST00000489435 TRIM41Q8WV44 630 aa35.57■■■■□ 3.28
DNAJA4-210ENST00000489435 SYNJ2O15056 1496 aa35.55■■■■□ 3.28
DNAJA4-210ENST00000489435 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.51■■■■□ 3.28
DNAJA4-210ENST00000489435 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.51■■■■□ 3.28
DNAJA4-210ENST00000489435 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.51■■■■□ 3.28
DNAJA4-210ENST00000489435 ARHGEF11O15085 1522 aa35.47■■■■□ 3.27
DNAJA4-210ENST00000489435 ADAMTS12P58397 1594 aa35.36■■■■□ 3.25
DNAJA4-210ENST00000489435 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.36■■■■□ 3.25
DNAJA4-210ENST00000489435 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.35■■■■□ 3.25
DNAJA4-210ENST00000489435 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.3■■■■□ 3.24
DNAJA4-210ENST00000489435 GRIN2AQ12879 1464 aa35.29■■■■□ 3.24
DNAJA4-210ENST00000489435 KIF27Q86VH2 1401 aa35.17■■■■□ 3.22
DNAJA4-210ENST00000489435 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.16■■■■□ 3.22
DNAJA4-210ENST00000489435 ARAP1Q96P48 1450 aa35.16■■■■□ 3.22
DNAJA4-210ENST00000489435 NUP160Q12769 1436 aa35.13■■■■□ 3.21
DNAJA4-210ENST00000489435 CEP170Q5SW79 1584 aa35.12■■■■□ 3.21
DNAJA4-210ENST00000489435 IGF1RP08069 1367 aa35■■■■□ 3.19
DNAJA4-210ENST00000489435 CUL7Q14999 1698 aa34.99■■■■□ 3.19
DNAJA4-210ENST00000489435 SHROOM2Q13796 1616 aa34.89■■■■□ 3.18
DNAJA4-210ENST00000489435 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.85■■■■□ 3.17
DNAJA4-210ENST00000489435 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.84■■■■□ 3.17
DNAJA4-210ENST00000489435 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.84■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.1 ms