Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms