Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 ZBTB38-204ENST00000504673 590 ntTSL 311.93□□□□□ -0.53e-8■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 VPS52-217ENST00000478934 2602 ntTSL 211.84□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 METAP1-202ENST00000503247 653 ntTSL 511.05□□□□□ -0.647e-8■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 PSMB7-201ENST00000259457 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.679e-7■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 FOXRED1-216ENST00000533839 559 ntTSL 410.17□□□□□ -0.783e-7■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 METAP1-206ENST00000510107 770 ntTSL 57.57□□□□□ -1.27e-8■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 FRYL-211ENST00000507873 7031 ntTSL 1 (best)6.2□□□□□ -1.424e-8■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 ZBTB38-218ENST00000513570 649 ntTSL 1 (best)5.49□□□□□ -1.533e-8■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 FRYL-220ENST00000641795 5566 nt4.46□□□□□ -1.74e-8■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.094e-8■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 PCDH9-205ENST00000614931 461 ntTSL 1 (best)8.68□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 142.8
UTP3Q9NQZ2 MTSS1L-203ENST00000576338 518 ntTSL 318.93■□□□□ 0.621e-7■■■■■ 142.7
UTP3Q9NQZ2 ACVR2B-203ENST00000465020 1666 ntTSL 219.47■□□□□ 0.714e-8■■■■■ 142.6
UTP3Q9NQZ2 SOCS3-202ENST00000587578 361 ntTSL 419.46■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 142.6
UTP3Q9NQZ2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.685e-7■■■■■ 142.6
UTP3Q9NQZ2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.395e-7■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.395e-7■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.235e-7■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.095e-7■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -05e-7■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 ZMYM3-209ENST00000489332 5723 ntTSL 513.63□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 ZMYM3-201ENST00000314425 5536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.465e-7■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 ZMYM3-205ENST00000373984 5253 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.575e-7■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.472e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 MRPL38-204ENST00000464758 752 ntTSL 323.3■■□□□ 1.322e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 MRPL38-216ENST00000585475 580 ntTSL 522.4■■□□□ 1.182e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.882e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.872e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 MRPL38-213ENST00000493104 1116 ntTSL 220.37■□□□□ 0.852e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 MRPL38-203ENST00000461602 880 ntTSL 319.85■□□□□ 0.772e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.612e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.592e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 MRPL38-214ENST00000493383 727 ntTSL 218.73■□□□□ 0.592e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.582e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 AC087289.3-201ENST00000590947 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.35■□□□□ 0.532e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 MRPL38-206ENST00000474548 529 ntTSL 218.26■□□□□ 0.512e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 MRPL38-209ENST00000477736 843 ntTSL 217.96■□□□□ 0.472e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 MRPL38-215ENST00000494179 870 ntTSL 317.93■□□□□ 0.462e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 PCCB-217ENST00000484181 1683 ntTSL 317.78■□□□□ 0.442e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.282e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.262e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.12e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 PCCB-212ENST00000474833 921 ntTSL 515.51■□□□□ 0.072e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 PCCB-219ENST00000494742 547 ntTSL 415.46■□□□□ 0.072e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 PCCB-206ENST00000465423 582 ntTSL 415.45■□□□□ 0.062e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.022e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 PCCB-214ENST00000478469 4502 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.282e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 PCCB-203ENST00000462542 488 ntTSL 312.36□□□□□ -0.432e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 PCCB-213ENST00000475214 1295 ntTSL 210.99□□□□□ -0.652e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 PCCB-205ENST00000465176 570 ntTSL 510.38□□□□□ -0.752e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 PCCB-202ENST00000459873 534 ntTSL 49.81□□□□□ -0.842e-23■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.158e-8■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.198e-8■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.998e-8■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.868e-8■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 BOD1L1-201ENST00000040738 10565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.258e-8■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.439e-7■■■■■ 142.5
UTP3Q9NQZ2 TSC2-223ENST00000568566 542 ntTSL 39.04□□□□□ -0.963e-6■■■■■ 142.4
UTP3Q9NQZ2 PTK2B-203ENST00000397501 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 142.4
UTP3Q9NQZ2 PTK2B-205ENST00000420218 3941 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 142.4
UTP3Q9NQZ2 PTK2B-201ENST00000346049 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 142.4
UTP3Q9NQZ2 GTSE1-201ENST00000454366 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.534e-9■■■■■ 142.4
UTP3Q9NQZ2 PCYOX1-205ENST00000451279 648 ntTSL 410.5□□□□□ -0.737e-8■■■■■ 142.4
UTP3Q9NQZ2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.159e-7■■■■■ 142.4
UTP3Q9NQZ2 MACROD1-208ENST00000545464 899 ntTSL 325.88■■□□□ 1.739e-7■■■■■ 142.4
UTP3Q9NQZ2 MACROD1-206ENST00000542359 459 ntTSL 316.42■□□□□ 0.229e-7■■■■■ 142.4
UTP3Q9NQZ2 DIAPH3-201ENST00000267215 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 142.4
UTP3Q9NQZ2 SNU13-205ENST00000463675 786 ntTSL 316.32■□□□□ 0.24e-8■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.074e-8■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 SNU13-206ENST00000469028 736 ntTSL 511.78□□□□□ -0.524e-8■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.242e-6■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.982e-6■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 RHOC-210ENST00000425265 866 ntTSL 320.11■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 RHOC-217ENST00000527563 579 ntTSL 318.31■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 RHOC-218ENST00000528831 463 ntTSL 317.56■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 RHOC-212ENST00000468093 1042 ntTSL 316.27■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 AL603832.3-205ENST00000606954 680 ntTSL 216.21■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 RHOC-215ENST00000484054 521 ntTSL 514.55□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 RHOC-216ENST00000484280 891 ntTSL 513.8□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 AL603832.3-202ENST00000607158 807 ntTSL 512.82□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 RHOC-214ENST00000478447 420 ntTSL 212.41□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 AL603832.3-203ENST00000606505 813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 AL603832.3-204ENST00000605933 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.97□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 AL603832.3-201ENST00000471038 792 ntTSL 211.71□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 RHOC-211ENST00000436685 517 ntTSL 510.2□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.494e-7■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.484e-7■■■■■ 142.3
UTP3Q9NQZ2 CBFA2T2-206ENST00000397800 7449 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 142.1
UTP3Q9NQZ2 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.542e-9■■■■■ 142.1
UTP3Q9NQZ2 CBFA2T2-202ENST00000344201 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.562e-9■■■■■ 142.1
UTP3Q9NQZ2 CBFA2T2-204ENST00000359606 7274 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.652e-9■■■■■ 142.1
UTP3Q9NQZ2 CBFA2T2-209ENST00000492345 7803 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.732e-9■■■■■ 142.1
UTP3Q9NQZ2 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.079e-7■■■■■ 142.1
UTP3Q9NQZ2 ESYT2-205ENST00000497111 663 ntTSL 416.36■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 142.1
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