Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PGLYRP3Q96LB9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PGLYRP3Q96LB9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms