Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CAVIN3Q969G5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms