Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB39AQ14964 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms