Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLR2IP36954 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2IP36954 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2IP36954 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2IP36954 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2IP36954 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLR2IP36954 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms