Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHI3L1P36222 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms