Protein–RNA interactions for Protein: O15540

FABP7, Fatty acid-binding protein, brain, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FABP7O15540 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FABP7O15540 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FABP7O15540 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FABP7O15540 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FABP7O15540 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FABP7O15540 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FABP7O15540 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FABP7O15540 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FABP7O15540 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FABP7O15540 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FABP7O15540 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FABP7O15540 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FABP7O15540 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FABP7O15540 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FABP7O15540 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FABP7O15540 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FABP7O15540 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms