Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4Q9P0V3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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